1、单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法可以分析单细胞的转录组,但不能保留空间信息。相反,空间转录组学(ST)分析可以描绘组织切片中的空间区域,但没有单细胞基因组分辨率。
2、Stereoscope还依赖于常用的假设,即空间和单细胞数据的计数均遵循负二项分布。Stereoscope包含一个噪声术语作为“虚拟”细胞类型的一种形式,以解释不对称数据集,其中细胞类型在空间和单细胞数据中没有完美重叠。
3、通过对小鼠出生后follicle发育关键时间点的单细胞和空间转录组测序,发现ovarian基质细胞不仅是构成ovarian的主要细胞群之一,其细胞群和空间位置也与follicle发育密切相关。
1、单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法可以分析单细胞的转录组,但不能保留空间信息。相反,空间转录组学(ST)分析可以描绘组织切片中的空间区域,但没有单细胞基因组分辨率。
2、Stereoscope还依赖于常用的假设,即空间和单细胞数据的计数均遵循负二项分布。Stereoscope包含一个噪声术语作为“虚拟”细胞类型的一种形式,以解释不对称数据集,其中细胞类型在空间和单细胞数据中没有完美重叠。
3、通过对小鼠出生后follicle发育关键时间点的单细胞和空间转录组测序,发现ovarian基质细胞不仅是构成ovarian的主要细胞群之一,其细胞群和空间位置也与follicle发育密切相关。
1、单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法可以分析单细胞的转录组,但不能保留空间信息。相反,空间转录组学(ST)分析可以描绘组织切片中的空间区域,但没有单细胞基因组分辨率。
2、Stereoscope还依赖于常用的假设,即空间和单细胞数据的计数均遵循负二项分布。Stereoscope包含一个噪声术语作为“虚拟”细胞类型的一种形式,以解释不对称数据集,其中细胞类型在空间和单细胞数据中没有完美重叠。
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