1、性能 当公司网站的流量和内容不是很大时，Linux服务器的性能比Windows好很多，Linux服务器占用资源更少。稳定性 Windows系统是使用最广泛的操作系统，受到了很多黑客的攻击，相应的系统安全漏洞也会比较多。
对于Unix，绝大多数虚拟主机提供商一样，选用的是LINUX系统。\r\n\r\n虚拟主机是在网络服务器上分出一定的磁盘空间供用户放置站点、应用组件等，提供必要的站点功能、数据存放和传输功能。
目前最常用的就是Windows虚拟主机和LINUX虚拟主机，母机的操作系统是Windows虚拟主机的话，那么虚拟主机的操作系统也是Windows虚拟主机，反之则是LINUX虚拟主机系统。Windows虚拟主机系统和LINUX虚拟主机系统都有自己的优势。
虚拟主机windows操作系统和linux的都有，配置环境不一样，支持的网站程序也不一样，一般windows的支持asp、net等，linux的一般支持php+mysql，您在购买的时候根据自己的需求来选择就可以了。
虚拟主机的服务器一般采用Windows2000（NT）和UNIX（linux）两种服务器操作系统，两者各有所长。数据库空间也分为两类：Windows2000平台的IIS0/Access数据库空间和Linux平台的MySQL/PHP数据库空间。
第一，需求性。有些网站搭建的程序是ASP程序，那么它的需求就只能是Windows操作系统的虚拟主机，因此Linux并不支持ASP程序，而如果是PHP程序语言，建议选择Linux操作系统，支持性更全面。第二，稳定性。
目前使用最多的操作系统是Linux和微软的WindowsNT。两者各有所长。如果你觉得在Unix和NT之间很难选择，就不要犹豫地选择linux，如果您确实有ASP+ACCESS的网站要支持，请选择NT。
1、稳定性高 业界公认：Linux服务器比Windows服务器稳定性高；多年使用经验，Linux稳定性虽然比不上在IBM小型机上运行AIX，但是比Windows服务器确实高很多。
2、开源：Linux 是一个开源操作系统，这意味着它的源代码是公开的，可以被任何人查看，修改或分发。这使得它可以根据公司的特定需求进行定制。安全性：Linux 的设计模式使得它在安全性方面表现出色。
3、Linux是世界上最灵活的操作系统，没有之一，您可以根据需要自定义系统。
4、和Unix系统一样，Linux系统是一个真正的多用户多任务的操作系统。
5、作为一个真正的多用户、多任务操作系统，使用Linux虚拟主机，每个用户都可以对自己的资源拥有特定的权限，并且互不影响；同时多个用户可以在同一时间以网络联机的方式使用计算系统。
6、大部分人用Linux通常只是用来测试或者学习，不需要正式环境，也不需要太高的性能，虚拟机可以方便的在原来的系统中进行操作和控制。