推荐你使用 N点虚拟主机管理系统 完全免费。里面就可设置二级域名绑定子目录功能。或者在IIS里面再新建一个网站绑定你的二级域名，然后把文件目录指向你要设置的子目录。
登录FTP——相应目录——按右键——属性！在属性中可以看到文件夹的权限设置。在Read前面打勾，表示可读，在Write前面打勾，表示可写，在Execcute前面打勾。表示可执行。可以在前面打勾来更改权限。
你这已经是根目录了，db是数据库的文件夹，log是日志的文件夹，web是网站页面的文件夹，那三个已经是这个目录的子目录了。
会看到一个default目录，里面是phpadmian、xcache等等扩展的目录，里面有一个index可以直接删掉，访问VPS的IP的话，会直接显示这个index。
配置 Apache 虚拟主机 1 现在，我们虚拟了两个域名，让它们指向了本地的电脑，访问它们，打开的是同一个目录里的内容，下面这个练习，我们通过修改 Apache 的配置文件，让访问不同域名的时候，打开的是不同的目录。
1、文件放到云虚拟主机中有2种方式，一种是通过ftp类软件或者http协议将文件上传至云虚拟主机中，正常情况下需要知道云虚拟主机的用户名和密码才能进行拷贝。
2、网页多的话，在根目录只当index.html等少数几个html页面就行了，其它的还是分门别类放在相应子目录里比较好。如果非要放在根目录下，就要对文件的名字动脑筋了。
3、在虚拟主机的后台中上传，一般会上传到文件的根目录。比如将网站上传到host-ease主机上，就需要登陆cpanel控制面板，将文件上传到根目录下。
4、htdocs/：万网虚拟主机网站的根目录，请将您的网站文件(php， htm， html， css， js等)上传至此文件夹。htdocs/logreport/： 访问统计报告存放目录，不占用空间，只可读取。
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